เจ้าอนัตวรฤทธิเดชฯ มีพระชายา , ชายา และหม่อม 12 องค์ และราชโอรส ราชธิดา 30 พระองค์ ดังนี้

• พระชายาที่ 1 แม่เจ้าสุนันทาอัครราชเทวี ประสูติกาล ราชโอรสและราชธิดา 6 พระองค์

1. เจ้าอุปราช (เจ้ามหาพรหม ณ น่าน)
2. พระเจ้าสุริยพงษ์ผริตเดชฯ พระเจ้านครเมืองน่าน
3. เจ้าอุปราช (เจ้าสิทธิสาร ณ น่าน)
4. เจ้าราชบุตร (เจ้าบุญรังษี ณ น่าน)
5. เจ้านางหมอกแก้ว
6. เจ้านางคำทิพ

• พระชายาที่ 2 แม่เจ้าขอดแก้วอัครเทวี ประสูติกาลราชโอรสและราชธิดา 2 พระองค์

1. เจ้ามหาพรหมสุรธาดา เจ้านครเมืองน่าน พระองค์ที่ 64
2. เจ้านางยอดมโนลา

• พระชายาที่ 3 แม่เจ้าคำปิวเทวี ไม่มีพระประสูติกาล

• พระชายาที่ 4 แม่เจ้าบัวเขียวเทวี ประสูติกาลราชธิดา 1 พระองค์

1. เจ้านางปิว

• พระชายาที่ 5 แม่เจ้าแว่นเทวี ประสูติกาล ราชโอรสและราชธิดา 3 พระองค์

1. เจ้านางแก้วไหลมา
2. เจ้านางบุษบา
3. เจ้าน้อยบุญสวรรค์

• พระชายาที่ 6 แม่เจ้าอัมราเทวี ประสูติกาล ราชโอรสและราชธิดา 2 พระองค์

1. เจ้าน้อยฟ้าร่วนเมืองอิน
2. เจ้านางขันคำ

• พระชายาที่ 7 แม่เจ้าปาริกาเทวี ประสูติกาล ราชโอรสและราชธิดา 8 พระองค์

1. เจ้าบุรีรัตน (เจ้าน้อยบรม ณ น่าน)
2. เจ้าน้อยบัวเลียว
3. เจ้าหยั่งคำเขียว
4. เจ้าราชสัมพันธ์วงษ์ (เจ้าน้อยบัวลองป่องฟ้าบุนทนาวงษ์)
5. เจ้าน้อยหมอกมุงเมือง
6. เจ้าราชบุตร (เจ้ารัตนเรืองรังษี ณ น่าน)
7. เจ้าน้อยสุทธนะ
8. เจ้านางคำเขียว

• พระชายาที่ 8 แม่เจ้าสุคันธาเทวี ประสูติกาล ราชโอรสและราชธิดา 4 พระองค์

1. เจ้าราชบุตร (เจ้าน้อยอนุรศรังษี)
2. เจ้านางเกียงคำ
3. เจ้านางเหมือย
4. เจ้านางสาวดี

• พระชายาที่ 9 แม่เจ้าแว่นเทวี ไม่มีพระประสูติกาล

• หม่อมที่ 10 หม่อมแก้ว ณ น่าน ประสูติราชโอรสและราชธิดา 2 พระองค์

1. เจ้าหนานมหาวงษ์
2. เจ้านางปอก

• หม่อมที่ 11 หม่อมคำแปง ณ น่าน ประสูติราชโอรสและราชธิดา 2 พระองค์

1. เจ้าน้อยนนต์
2. เจ้านางบัวแฝง

• หม่อมที่ 12 บาทบริจาริกา ประสูติราชโอรส 1 พระองค์

1. เจ้าหนานมหาวงษ์

รวมพระราชโอรส พระราชธิดา ในเจ้าอนันตวรฤทธิเดชฯ เจ้านครเมืองน่าน 30 พระองค์ แบ่งเป็น

• พระราชโอรส 18 พระองค์
• พระราชธิดา 12 พระองค์